Он скончался 11 января, не дожив до 89-летия всего месяц. Причиной смерти называют тромбоз, который развился после перенесенного коронавируса. Прощание с политиком прошло в государственном концертном зале «Башкортостан». Проститься с Муртазой Губайдулловичем прилетели политики из других регионов страны, а также Владимир Путин.